Совет
Советот на Европска Куќа Скопје е највисокото одлучувачко тело. Советот е составен од сите членови на организацијата. Во моментов организацијата брои 31 член.
Извршен Одбор
Извршниот Одбор е извршно тело кое го сочинуваат вкупно 5 членови, вклучувајќи го Претседателот на организацијата и Генералниот секретар.
Членови на Извршниот Одбор се:
Зоран Димитров
Тони Масевски
М-р Срѓан Јанаќиевиќ
М-р Јон Ивановски
Васка Николовска
Надзорен Одбор
Надзорниот Одбор е контролно тело, заедно со Советот кој го сочинуваат 3 членови: